La Opera de la Primaziale Pisana es una institución nacida para supervisar los trabajos de la construcción de Plaza de los Milagros.
La Opera nació contemporáneamente a los trabajos para la constitución de los monumentos de Plaza de los Milagros, que ocuparon y caracterizaron toda la edad municipal en Pisa. Como certifican los dos famosos epígrafes en la fachada de la Catedral, en 1064 se colocaron las primeras piedras de la misma Catedral y se efectuaron las expediciones victoriosas contra las costas de Sicilia y el puerto del Palermo; y al tiempo del obispo Guido (fallecido en 1076) se levantó el nuevo templo.
Entre 1077 y 1120, durante los trabajos de edificación de la Catedral, la Opera no poseía todavía su propia identidad institucional. El término inició a utilizarse durante la última década del siglo XI, al tiempo de Daiberto, arzobispo de Pisa desde 1092, e indicaba precisamente los trabajos de construcción del monumento. La toma, por parte de la Municipalidad, de la autoridad de dirigir, por lo menos parte de estos trabajos, ocurrió mucho más tarde, es decir durante los primeros años del siglo XIII: efectivamente, en 1201/1202 por primera vez el Operario (el Administrador de la Opera) fue nombrado por el alcalde en lugar del arzobispo; y en 1207 una sentencia arbitral estableció la legitimidad de ese procedimiento.
Actualmente, la Opera, en calidad de "fábrica", está vigente bajo la Ley Concordataria de 1929, sobre la base de que está regulada por un Consejo de Administración constituido por siete mineros, nombrados cada tres años mediante decreto del Ministro del Interior, los cuales se ocupan de la elección del Presidente dentro de su propio ámbito.
Desde 1987, el conjunto monumental de Plaza de los Milagros ha sido reconocido por UNESCO "Patrimonio Mundial de la Humanidad".
Desde 1999, la Opera se configura jurídicamente como Organización sin fin de lucro (ONLUS), regulada por su propio Estatuto, que define, entre sus fines institucionales, la "tutela, la promoción y la valorización de su patrimonio artístico".